Caracterización molecular de cepas de Escherichia Coli del grupo clonal O25b:H4-B2-ST131 y de otros clones causantes de infecciones extraintestinales en seres humanosGenes de virulencia y de resistencia

Resumo

En los últimos años, las cepas de Escherichia coli del grupo clonal ST131 se han propagado rápidamente a nivel mundial. Por esa razón, nosotros nos planteamos estudiar las características de las cepas ST131 aisladas en los diferentes hospitales españoles y las comparamos con las cepas no-ST131. En el estudio I, al analizar 654 cepas de E. coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE) aisladas de pacientes entre 2005 y 2008 en 4 hospitales de Galicia, identificamos 5 grupos clonales productores de CTX-M-14 (O1:HNM-D-ST59, O15:H1-D-ST393, O20:H34/HNM-D-ST354, O25b:H4-B2-ST131 y ONT:H21,42-B1-ST101). Cada grupo clonal mostró un perfil de genes de virulencia y de resistencias específico. En el estudio II, al caracterizar 94 cepas de E. coli productoras de BLEE aisladas de pacientes de un Hospital de Barcelona en el año 2008, el grupo clonal O25b:H4-B-ST131 fue el más prevalente (32%), siendo el 63% de las cepas ST131 productoras de CTX-M-15 y el 27% de SHV-12. Las 30 cepas ST131 exhibieron un significativo mayor número de genes de virulencia (media 9,6) que las 64 cepas no ST131 (media 5,8). El estudio III es el primero europeo en el que se analizan conjuntamente los grupos clonales O25b:H4-B2-ST131, O15:H1-D-ST393 y GCA-D-ST69, y entre las 500 cepas de E. coli aisladas en 5 hospitales de España en el año 2009 (7% BLEE), observamos que el más prevalente fue el O25b:H4-B2-ST131 (12%). Las cepas ST131 presentaron el mayor número de genes de virulencia (media 8,1; rango 4 a 13 genes), comparado con las cepas ST393 (media 6,0; rango 3 a 7) y ST69 (media 5,4; rango 2 a 9). En el estudio IV, analizamos 1.021 cepas de E. coli productoras de BLEE que fueron aisladas en 44 hospitales españoles. Un total de 195 cepas (19%) fueron del grupo clonal O25b:H4-B2-ST131. Al caracterizar 130 cepas ST131 representativas, el 74% de ellas fueron productoras de CTX-M-15. Desarrollamos un sistema para clasificar las cepas ST131 atendiendo a sus genes de virulencia en virotipos y comprobamos que la mayoría de las cepas de un mismo virotipo se agrupaban clusters específicos generados por PFGE-XbaI implicando una base clonal. En el estudio V, analizamos 3.260 cepas de E. coli bacteriémicas aisladas en el Hospital Universitario Lucus Augusti (HULA) de Lugo entre los años 1989 y 2011. Entre estas cepas identificamos 9 filoserogrupos prevalentes (O1-D, O2-B2, O4-B2, O6-B2, O8-A, O9-A, O15-D, O18-B2 y O25-B2), siendo el O6-B2 el más prevalente en los períodos 1989-1998 y 1999-2008 y el O25-B2 en el período 2009-2011. Al analizar las 157 cepas ST131 bacteriémicas aisladas entre los años 1993 y 2011 de pacientes del HULA observamos que los 3 subclones mayoritarios (H30-Rx, H30 no-Rx y H22) son los mismos que predominaban en los estudios realizados recientemente en EE.UU. y Canadá. Como novedad concluimos que las cepas de los virotipos A, B, C, E y F pertenecen a los subclones H30-Rx y/ó H30 no-Rx, mientras que las cepas del virotipo D pertenecen al subclón H22. Como en los estudios realizados en EE.UU. y Canadá observamos que durante los primeros años (1993-1999) las cepas H22 eran las más prevalentes, pero desde que emergieron en el 2001 las cepas H30 se fue incrementando continuamente su prevalencia siendo en la actualidad las predominantes. De especial interés clínico es la asociación del subclón H30-Rx con la producción de CTX-M-15. Además, nuestros resultados indican que las cepas del subclón H30-Rx poseen un mayor número de genes de virulencia que las cepas del subclón H30 no-Rx. No obstante, ambos subclones están expandiéndose en la actualidad, predominando el subclón H30-Rx entre las cepas productoras de BLEE y el H30 no-Rx entre las cepas resistentes a las quinolonas fluoradas no productoras de BLEE. Nuestros resultados también coinciden con los encontrados por otros autores en el sentido que a nivel internacional predominan las cepas O25b:H4-B2-ST131 H30 del virotipo C.